RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 PIGKQ92643 395 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 TCEAL3Q969E4 200 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 RAB7BQ96AH8 199 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
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PDE4D-201ENST00000309641 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 PREBQ9HCU5 417 aa9.14□□□□□ -0.95
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF592Q92610 1267 aa9.13□□□□□ -0.95
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PDE4D-201ENST00000309641 SLC6A18Q96N87 628 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
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PDE4D-201ENST00000309641 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.13□□□□□ -0.95
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PDE4D-201ENST00000309641 RAB23Q9ULC3 237 aa9.13□□□□□ -0.95
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PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PPC4 97 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 CFAP69A5D8W1 941 aa9.12□□□□□ -0.95
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PDE4D-201ENST00000309641 C6P13671 934 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 ADRA1AP35348 466 aa9.12□□□□□ -0.95
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PDE4D-201ENST00000309641 PARP6Q2NL67 630 aa9.12□□□□□ -0.95
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PDE4D-201ENST00000309641 KCTD11Q693B1 232 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 DPPA4Q7L190 304 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.12□□□□□ -0.95
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PDE4D-201ENST00000309641 POM121BA6NF01 834 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 EPN2O95208 641 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 CLDN7O95471 211 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 NDST3O95803 873 aa9.12□□□□□ -0.95
PDE4D-201ENST00000309641 WNT1P04628 370 aa9.12□□□□□ -0.95
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PDE4D-201ENST00000309641 CD27P26842 260 aa9.12□□□□□ -0.95
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