RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 WNT6Q9Y6F9 365 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PPM1 405 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35F4A4IF30 521 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MTSS1O43312 755 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC22O60826 627 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 DAB1O75553 588 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF19O95750 216 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 APOEP02649 317 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 APRTP07741 180 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINF2P08697 491 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNE1P15382 129 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PAX3P23760 479 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 RBL1P28749 1068 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC25CP30307 473 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 L1CAMP32004 1257 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 NEK3P51956 506 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT72Q14CN4 511 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CRY1Q16526 586 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MGAT5BQ3V5L5 792 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNDC8Q6A555 127 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PMF1Q6P1K2 205 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ITIH5Q86UX2 942 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PGBD3Q8N328 593 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PPM1NQ8N819 430 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 NSL1Q96IY1 281 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PEBP4Q96S96 227 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 WWP1Q9H0M0 922 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 USP29Q9HBJ7 922 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CD248Q9HCU0 757 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 NPHS2Q9NP85 383 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 COL12A1Q99715 3063 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0A0MRY4 1105 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 KPNA7A9QM74 516 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 K7EQS6 105 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMD3O43242 534 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJC6O75061 913 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 BANF1O75531 89 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 GRAP2O75791 330 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ALDH1A2O94788 518 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 OAZ2O95190 189 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT16P08779 473 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CALB2P22676 271 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ADRA1DP25100 572 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ADORA2BP29275 332 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 WEE1P30291 646 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CRHR1P34998 444 aa7.12□□□□□ -1.27
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