RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261609.11

HERC2-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC2, Length 15,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-201ENST00000261609 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 FAM129BQ96TA1 746 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 DHRS7Q9Y394 339 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 CEP152O94986 1710 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 USP31Q70CQ4 1352 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 IRGMA1A4Y4 181 aa7.19□□□□□ -1.26
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HERC2-201ENST00000261609 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 RDH11Q8TC12 318 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 ITSN1Q15811 1721 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.19□□□□□ -1.26
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HERC2-201ENST00000261609 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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HERC2-201ENST00000261609 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 CHIAQ9BZP6 476 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 RASSF1Q9NS23 344 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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HERC2-201ENST00000261609 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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HERC2-201ENST00000261609 ALG5Q9Y673 324 aa7.19□□□□□ -1.26
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HERC2-201ENST00000261609 CRATP43155 626 aa7.19□□□□□ -1.26
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HERC2-201ENST00000261609 SLC22A1O15245 554 aa7.19□□□□□ -1.26
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HERC2-201ENST00000261609 AMHR2Q16671 573 aa7.19□□□□□ -1.26
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HERC2-201ENST00000261609 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 SNX6Q9UNH7 406 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 ALDH1A2O94788 518 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 CYP2A7P20853 494 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 OXCT1P55809 520 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC2-201ENST00000261609 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.18□□□□□ -1.26
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