RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040584.5

HOXC8-201, Transcript of homeobox C8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC8, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 CFAP36Q96G28 342 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 BFARQ9NZS9 450 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 CDK18Q07002 472 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 DLG2Q15700 870 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 SLC1A5Q15758 541 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 IFT43Q96FT9 208 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 MRGPRX3Q96LB0 322 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 ATP9BO43861 1147 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 BNIP3LO60238 219 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 FAM155BO75949 473 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 MT-ND3P03897 115 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 CCND1P24385 295 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 SOX9P48436 509 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 NPY2RP49146 381 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 MGAT5Q09328 741 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 BANPQ8N9N5 519 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 MZB1Q8WU39 189 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 NAT9Q9BTE0 207 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 GGT7Q9UJ14 662 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 CHKBQ9Y259 395 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 GKP32189 559 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 PTPRNQ16849 979 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 LGSNQ5TDP6 509 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 CCNJLQ8IV13 435 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 INPP5DQ92835 1189 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 FEM1CQ96JP0 617 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 TMEM237Q96Q45 408 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 IL22Q9GZX6 179 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 KCNK12Q9HB15 430 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 IGSF6O95976 241 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 KCNJ2P63252 427 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 GALNT3Q14435 633 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 STEAP4Q687X5 459 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 TERB1Q8NA31 727 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 OR2AP1Q8NGE2 309 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 MYO19Q96H55 970 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 CEP44Q9C0F1 390 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC8-201ENST00000040584 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 TTC34A8MYJ7 566 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 WFS1O76024 890 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 EPOP01588 193 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 ASLP04424 464 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 PGAM1P18669 254 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 TRAF2Q12933 501 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 POU6F1Q14863 301 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 TRIB3Q96RU7 358 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 INHBAP08476 426 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 PDHA1P08559 390 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 NNMTP40261 264 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 CSNK1DP48730 415 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 AP1S1P61966 158 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 Q6ZVU0 165 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 SAR1AQ9NR31 198 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 PRLP01236 227 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 C1QAP02745 245 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 SLC18A2Q05940 514 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 CARD16Q5EG05 197 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 CES3Q6UWW8 571 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC8-201ENST00000040584 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms