RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam124bQ8BLQ0 456 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CenpuQ8C4M7 410 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc159Q8C963 411 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc87Q8CDL9 855 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm42417Q8K1D0 126 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 HpdlQ8K248 371 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cd300ldQ8VCH2 221 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Themis2Q91YX0 663 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tspan1Q99J59 240 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ska2Q9CR46 120 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Thumpd2Q9CZB3 528 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dus2Q9D7B1 493 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trim44Q9QXA7 346 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dock6Q8VDR9 2080 aa12.14□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wdfy4E9Q2M9 3149 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Spag17Q5S003 2320 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 AspgA0JNU3 564 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Faap100A2ACJ2 879 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cfap221A9Q751 836 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gsg1l2M0QWL6 290 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Klf6O08584 283 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cd2P08920 344 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rps6ka1P18653 724 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 TrhrP21761 393 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dynlt1P51807 113 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccna2P51943 422 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PltpP55065 493 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rpl26P61255 145 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 LchnQ3UHG7 455 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pnliprp1Q5BKQ4 473 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp36l3Q5ISE2 725 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nxph1Q61200 271 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pon2Q62086 354 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zswim9Q6DI92 447 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Defb14Q7TNV9 67 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 AdalQ80SY6 360 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmtc4Q8BG19 741 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 C130026I21RikQ8C898 291 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rsad2Q8CBB9 362 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Crispld1Q8CGD2 500 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gle1Q8R322 699 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Imp4Q8VHZ7 291 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Laptm4bQ91XQ6 227 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mthfd1Q922D8 935 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nrif1Q923B3 828 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prdm9Q96EQ9 843 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 L3hypdhQ9CXA2 354 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Arl2Q9D0J4 184 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ppil1Q9D0W5 166 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 DtnaQ9D2N4 746 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Krt20Q9D312 431 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tchhl1Q9D3P1 638 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 HaghlQ9DB32 283 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vwa7Q9JHA8 891 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kat2bQ9JHD1 813 aa12.13□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm3285A0A1W2P7U0 201 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tubb1A2AQ07 451 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp780bE9Q2S6 806 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vmn1r39G3UWE6 305 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nccrp1G3X9C2 266 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vmn2r8L7N472 848 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pold2O35654 469 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gpr27O54897 379 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fpr1P33766 364 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Aup1P70295 410 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SgcgP82348 291 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mc1rQ01727 315 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Igsf9Q05BQ1 1179 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Uap1l1Q3TW96 507 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Garem1Q3UFT3 876 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PtprrQ62132 656 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CcncQ62447 283 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mc2rQ64326 296 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Snx31Q6P8Y7 439 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tas2r102Q7M717 329 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Disc1Q811T9 852 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mterf2Q8BKY8 385 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ttc34Q8C0Q3 554 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vmn1r214Q8R279 367 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Irf2bp1Q8R3Y8 584 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rab7bQ8VEA8 199 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mtfr2Q8VED8 361 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 DcxrQ91X52 244 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Edem1Q925U4 652 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cyp4f15Q99N18 534 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ogfod2Q9CQ04 349 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sp2Q9D2H6 612 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Marveld3Q9D956 376 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Znf654Q9DAU9 571 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CtsmQ9JL96 333 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 NagaQ9QWR8 415 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rad1Q9QWZ1 280 aa12.12□□□□□ -0.47
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Enpp2Q9R1E6 862 aa12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.1 ms