RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 C14orf80Q86SX3 495 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 RAPGEF5Q92565 580 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHDC7BQ96G42 594 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 ERLIN1O75477 346 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 MT-CO1P00395 513 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 F9P00740 461 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 THEGLP0DJG4 465 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 GGCXP38435 758 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF284Q2VY69 593 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 C5orf22Q49AR2 442 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ARTNQ5T4W7 220 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 IFT20Q8IY31 132 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC14L1Q92503 715 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 KLK6Q92876 244 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ARRDC3Q96B67 414 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 MYOCQ99972 504 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 COL6A6A6NMZ7 2263 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SRCP12931 536 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 MYF5P13349 255 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 DRG2P55039 364 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ACCSLQ4AC99 568 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 RABGAP1LQ5R372 815 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC13Q8NBP0 860 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD6Q8NC69 237 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 OR13H1Q8NG92 308 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 FZD3Q9NPG1 666 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 DDIT4Q9NX09 232 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A13Q9UJS0 675 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 VANGL2Q9ULK5 521 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 HS3ST2Q9Y278 367 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 HS3ST4Q9Y661 456 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQU0 124 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRD1A4D1F6 860 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 I6L893 689 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC31A1O15431 190 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD51CO43502 376 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 OPA1O60313 960 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 PIAS2O75928 621 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CKMT1AP12532 417 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CCR1P32246 355 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 COILP38432 576 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 OXCT1P55809 520 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CXADRP78310 365 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP11AP98196 1134 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ERMARDQ5T6L9 678 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 GCNT7Q6ZNI0 430 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF683Q8IZ20 524 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2A12Q8NGT7 310 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZWILCHQ9H900 591 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR27Q9NS67 375 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 K7ERQ8 282 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 DXOO77932 396 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 VSNL1P62760 191 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 BBS12Q6ZW61 710 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 COL26A1Q96A83 441 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 PEBP4Q96S96 227 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 FFAR2O15552 330 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP8B1O43520 1251 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SNAP91O60641 907 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTN5O94779 1100 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 MPOP05164 745 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC2A3P11169 496 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 DR1Q01658 176 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 DPYSL2Q16555 572 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP9Q49MG5 647 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 NEK5Q6P3R8 708 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 HORMAD1Q86X24 394 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ATL2Q8NHH9 583 aa24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms