RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 NTSR1P30989 418 aa21.76■■□□□ 1.07
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SGMS1-210ENST00000619438 SGSHP51688 502 aa21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 SLC20A2Q08357 652 aa21.76■■□□□ 1.07
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SGMS1-210ENST00000619438 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.76■■□□□ 1.07
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SGMS1-210ENST00000619438 PPM1NQ8N819 430 aa21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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SGMS1-210ENST00000619438 RAB23Q9ULC3 237 aa21.76■■□□□ 1.07
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SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.75■■□□□ 1.07
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SGMS1-210ENST00000619438 TRIM49D1C9J1S8 452 aa21.73■■□□□ 1.07
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SGMS1-210ENST00000619438 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.73■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.73■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.73■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 HCN2Q9UL51 889 aa21.73■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 PLA2G4CQ9UP65 541 aa21.73■■□□□ 1.07
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