RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 KYQ8NBH2 561 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 CNPY3Q9BT09 278 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 APOOQ9BUR5 198 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 PDFQ9HBH1 243 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 RABGEF1Q9UJ41 708 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD62A6NC57 917 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 K7ENP7 123 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 RASGRP1O95267 797 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 ITGA2BP08514 1039 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 CTSEP14091 401 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 HTR1BP28222 390 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 ENPP7Q6UWV6 458 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 MCEEQ96PE7 176 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC19Q9H756 370 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 FANCLQ9NW38 375 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 SIRPGQ9P1W8 387 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 LRRK1Q38SD2 2015 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 LIG3P49916 1009 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 SRP54P61011 504 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 CLN3Q13286 438 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 TCEA2Q15560 299 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 ERAP2Q6P179 960 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 BRAT1Q6PJG6 821 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 RD3Q7Z3Z2 195 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 NEK11Q8NG66 645 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC74AQ96AQ1 378 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 AGPAT1Q99943 283 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA4CQ9C0C4 833 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 GPR34Q9UPC5 381 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 OR1A2Q9Y585 309 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 J3KR12 359 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 HTR7P34969 479 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 MMP12P39900 470 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 NDST2P52849 883 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 ZSWIM9Q86XI8 627 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 GKN2Q86XP6 184 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 DONSONQ9NYP3 566 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 PLD2O14939 933 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF11O60813 436 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 TPI1P60174 286 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 CCL7P80098 99 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 LY6DQ14210 128 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP58Q5T655 872 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 CAMK1DQ8IU85 385 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 ATL2Q8NHH9 583 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 WDR92Q96MX6 357 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 KLQ9UEF7 1012 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PQM1 296 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 LGALS16A8MUM7 142 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 D6RAR5 112 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 PCCBP05166 539 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 CSNK1DP48730 415 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 OGDHQ02218 1023 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 MTM1Q13496 603 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD16Q68DU8 428 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 DCUN1D2Q6PH85 259 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC81Q6ZN84 652 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 OR6C4Q8NGE1 309 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 EPB41L5Q9HCM4 733 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 DGKBQ9Y6T7 804 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 LRP4O75096 1905 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP69A5D8W1 941 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 J3QKU1 62 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 TNFP01375 233 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 PRKCGP05129 697 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 RGRP47804 291 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 ACAD10Q6JQN1 1059 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 RAB11FIP2Q7L804 512 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 MCOLN2Q8IZK6 566 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO39Q8N4B4 442 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 PLA2G15Q8NCC3 412 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 GPR156Q8NFN8 814 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 PDXPQ96GD0 296 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PTPRF-216ENST00000617451 FOXP3Q9BZS1 431 aa25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms