RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEPT6Q14141 434 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANGPT1Q15389 498 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AGBL4Q5VU57 503 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C4orf22Q6V702 233 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DEFB119Q8N690 84 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TADA1Q96BN2 335 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SNF8Q96H20 258 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPACA7Q96KW9 195 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCML1Q9UN30 329 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TSPAN11A1L157 253 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC78A2IDD5 438 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FZD6O60353 706 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDH8O95206 1070 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRLP01236 227 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ACSL1P33121 698 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GRIA1P42261 906 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GRIA4P48058 902 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADPRHP54922 357 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GUCY2DQ02846 1103 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZBTB16Q05516 673 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNJ11Q14654 390 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC1A5Q15758 541 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 QPCTQ16769 361 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UGP2Q16851 508 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERAP2Q6P179 960 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP45Q70EL2 814 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KBTBD6Q86V97 674 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CPT1BQ92523 772 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SNX19Q92543 992 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KLK6Q92876 244 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIB3Q96RU7 358 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HDAC8Q9BY41 377 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAB17Q9H0T7 212 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DKK3Q9UBP4 350 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NUMA1Q14980 2115 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAPN8A6NHC0 703 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSMD3O43242 534 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPINT1O43278 529 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FGF1P05230 155 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TPH1P17752 444 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HLA-DPA1P20036 260 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HNF1BP35680 557 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ITGA8P53708 1063 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC14A2Q15849 920 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCTD11Q693B1 232 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP30Q70CQ3 517 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms