RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM170B	A6NMN3	283 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRNP	P04156	253 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELK3	P41970	407 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FZD5	Q13467	585 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP9	Q49MG5	647 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC38	Q502W7	563 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CASC4	Q6P4E1	433 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYBU	Q9NX95	663 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		9.22	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALOX15B	O15296	676 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERLIN1	O75477	346 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTPS1	P17812	591 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAGEA4	P43358	317 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	STARD3	Q14849	445 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	QPCT	Q16769	361 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL22	Q9GZX6	179 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		9.21	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0U1RQS6	177 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	AP3B1	O00203	1094 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	STK25	O00506	426 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALPI	P09923	528 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL9A1	P20849	921 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPY2R	P49146	381 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLMAP	Q14BN4	828 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMIE	Q8NEW7	156 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAVIN3	Q969G5	261 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	CP	P00450	1065 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALAD	P13716	330 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRIA4	P48058	902 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMD8	P48556	350 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZXDA	P98168	799 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	SATB1	Q01826	763 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEMG2	Q02383	582 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	CBLB	Q13191	982 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAS6	Q14393	721 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	KYNU	Q16719	465 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	UGP2	Q16851	508 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPOCK2	Q92563	424 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD248	Q9HCU0	757 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		9.21	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0J9YYE9	177 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC78	A2IDD5	438 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLK4	O00444	970 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	AURKA	O14965	403 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRBC1	P01850	177 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABL2	P42684	1182 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	COPA	P53621	1224 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC32	Q14392	662 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	EOGT	Q5NDL2	527 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTC7B	Q86TV6	843 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	RELL1	Q8IUW5	271 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	FLCN	Q8NFG4	579 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR2T3	Q8NH03	318 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC39	Q96DD0	335 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF778	Q96MU6	729 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	NELL2	Q99435	816 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		9.2	□□□□□ -0.94
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		9.2	□□□□□ -0.94

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms