RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 CSNK1DP48730 415 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 HCAR3P49019 387 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 GRM3Q14832 879 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 UGP2Q16851 508 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 HGSNATQ68CP4 663 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 PDZD3Q86UT5 571 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ZSWIM9Q86XI8 627 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 RBFAQ8N0V3 343 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 MYRIPQ8NFW9 859 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ZNF592Q92610 1267 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ZNF653Q96CK0 615 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 TBATAQ96M53 351 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 DNAJC7Q99615 494 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 NCAPGQ9BPX3 1015 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ISCUQ9H1K1 167 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 PCDH12Q9NPG4 1184 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 SALL4Q9UJQ4 1053 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 AK5Q9Y6K8 562 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 SCINQ9Y6U3 715 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 MYLKQ15746 1914 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 TPP1O14773 563 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 GCATO75600 419 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 PALMO75781 387 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 CCDC175P0C221 793 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 MYBL1P10243 752 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 IL1R2P27930 398 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 PCK1P35558 622 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ZBED6P86452 979 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ELP6Q0PNE2 266 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 DPYSQ14117 519 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 PTK2BQ14289 1009 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 AGERQ15109 404 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 IRF4Q15306 451 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 WSCD2Q2TBF2 565 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 DEFB133Q30KQ1 61 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 BRAT1Q6PJG6 821 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 MACC1Q6ZN28 852 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 SRLQ86TD4 932 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 CAMK1DQ8IU85 385 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 TP53INP2Q8IXH6 220 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 PHACTR4Q8IZ21 702 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 LMX1AQ8TE12 382 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 BTN2A2Q8WVV5 523 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 TRIM11Q96F44 468 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 NSMCE3Q96MG7 304 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 SPASTQ9UBP0 616 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 COQ6Q9Y2Z9 468 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ADGRG1Q9Y653 693 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 UQCRHLA0A096LP55 91 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 MUSKO15146 869 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 DAPK3O43293 454 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 BRINP1O60477 761 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 UQCRHP07919 91 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 C6P13671 934 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 TCF4P15884 667 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 XPAP23025 273 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 MMP12P39900 470 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 THOP1P52888 689 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 SEMG2Q02383 582 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 IL10RBQ08334 325 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ACAP1Q15027 740 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 LRRC14Q15048 493 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 DPYSL2Q16555 572 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 KIF18AQ8NI77 898 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 IFI44Q8TCB0 444 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ECHDC3Q96DC8 303 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 DESI2Q9BSY9 194 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 LRRC61Q9BV99 259 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 BOCQ9BWV1 1114 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 CLPBQ9H078 707 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 EVA1BQ9NVM1 165 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 MYO1AQ9UBC5 1043 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-210ENST00000591412 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CTIF-210ENST00000591412 CFAP69A5D8W1 941 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-210ENST00000591412 LMO7DNF2Z398 122 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-210ENST00000591412 DFFAO00273 331 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-210ENST00000591412 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms