RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC44A3Q8N4M1 653 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 LPCAT1Q8NF37 534 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CERS2Q96G23 380 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 LIMD1Q9UGP4 676 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CKAP5Q14008 2032 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MROH6A6NGR9 719 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CRTAMO95727 393 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QAP02745 245 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF4P43489 277 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 EPHB1P54762 984 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE1BQ01064 536 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC6Q86X45 466 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFAF2Q8N183 169 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6K2Q8NGY2 324 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 ECHDC3Q96DC8 303 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD3Q96ES6 412 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RY13Q9BPV8 354 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TRABDQ9H4I3 376 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 SUV39H2Q9H5I1 410 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TREX1Q9NSU2 369 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS13Q9UHV8 139 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TLDC2A0PJX2 215 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP5DP30049 168 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MGAT5Q09328 741 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 SEPT6Q14141 434 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 QPCTQ16769 361 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TSTD2Q5T7W7 516 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PDPK2PQ6A1A2 396 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PIH1D2Q8WWB5 315 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPRN2Q92932 1015 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 DHRS4Q9BTZ2 278 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.594e-11■□□□□ 10.6
CAPNS1-206ENST00000588815 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 IKBKGQ9Y6K9 419 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGNO95427 931 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 NMBRP28336 390 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MSH2P43246 934 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PFKPQ01813 784 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF234Q14588 700 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 HCAR2Q8TDS4 363 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MSANTD3Q96H12 275 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PAFAH2Q99487 392 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf43Q9BQ61 176 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM245Q9H330 911 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEE1Q9HCI5 957 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 EURLQ9NYK6 297 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PHTF1Q9UMS5 762 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 SCN8AQ9UQD0 1980 aa31.2■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 LDB2O43679 373 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 BNIP3LO60238 219 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 GLULP15104 373 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 CTHP32929 405 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRD1Q6QNK2 874 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC44A1Q8WWI5 657 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 VOPP1Q96AW1 172 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SUN2Q9UH99 717 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF180Q9UJW8 692 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIL1Q9Y3C6 166 aa31.2■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 GCAP28676 217 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 GALK1P51570 392 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SKIDA1Q1XH10 827 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 CES3Q6UWW8 571 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 GDPD4Q6W3E5 623 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT222Q8N1A0 295 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 PAF1Q8N7H5 531 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 STYXQ8WUJ0 223 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 IL36AQ9UHA7 158 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf81A6NN90 581 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 INHBAP08476 426 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 NFKBIAP25963 317 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SLCO1A2P46721 670 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ACVR1Q04771 509 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-206ENST00000588815 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
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