RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570484.1

CTDNEP1-204, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 393 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FLCNQ8NFG4 579 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 GANCQ8TET4 914 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FRS2Q8WU20 508 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ACOX2Q99424 681 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 HINFPQ9BQA5 517 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 APOL2Q9BQE5 337 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TMEM245Q9H330 911 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 GDF3Q9NR23 364 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 BFARQ9NZS9 450 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NFU1Q9UMS0 254 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 COL4A2P08572 1712 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 KRBA1A5PL33 1030 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM170BA6NMN3 283 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 WASH3PC4AMC7 463 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NEMP1O14524 444 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 USP12O75317 370 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 LEFTY1O75610 366 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 GJB3O75712 270 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SUN1O94901 812 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PGLSO95336 258 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NDST3O95803 873 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 DNTTP04053 509 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MLNP12872 115 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ALADP13716 330 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MAGEA6P43360 314 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MAGEA9P43362 315 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NEK3P51956 506 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 STARD6P59095 220 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 VSNL1P62760 191 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZXDAP98168 799 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRAF2Q12933 501 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 LAMB3Q13751 1172 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SPARCL1Q14515 664 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC1A5Q15758 541 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 BBS9Q3SYG4 887 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 EMC10Q5UCC4 262 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 WDR93Q6P2C0 686 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 KDELC1Q6UW63 502 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 Q6ZS52 159 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CHST14Q8NCH0 376 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MCUQ8NE86 351 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PJA1Q8NG27 643 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR2T3Q8NH03 318 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SEC14L1Q92503 715 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 PTPRN2Q92932 1015 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ART4Q93070 314 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SERPINB12Q96P63 405 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 GABRG3Q99928 467 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 IER2Q9BTL4 223 aa6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FOXQ1Q9C009 403 aa6.63□□□□□ -1.35
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