RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564582.2

CHD9-210, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 9, humanhuman

TSL 3

Gene CHD9, Length 968 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9-210ENST00000564582 STAT2P52630 851 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 VCPP55072 806 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 C21orf59P57076 290 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 KRT17Q04695 432 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 MGAT2Q10469 447 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 COASYQ13057 564 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 PPIL2Q13356 520 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 PPP2R5CQ13362 524 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 TUBA3CQ13748 450 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 PTK2BQ14289 1009 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 GRM4Q14833 912 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 FAM214AQ32MH5 1076 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 CGB2Q6NT52 195 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 TTC23LQ6PF05 361 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 C16orf89Q6UX73 402 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 C4orf22Q6V702 233 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 FAM47EQ6ZV65 393 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 ARPINQ7Z6K5 226 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 ZNF677Q86XU0 584 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 TTC30BQ8N4P2 665 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 PACRGLQ8N7B6 248 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 MAGEB6Q8N7X4 407 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.69□□□□□ -1.5
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CHD9-210ENST00000564582 GDPD5Q8WTR4 605 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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CHD9-210ENST00000564582 C18orf8Q96DM3 657 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 MTMR9Q96QG7 549 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 RMDN3Q96TC7 470 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 CYTH2Q99418 400 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 AGPAT1Q99943 283 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 FERMT1Q9BQL6 677 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 HIPK3Q9H422 1215 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 USP29Q9HBJ7 922 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 POLD4Q9HCU8 107 aa5.69□□□□□ -1.5
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CHD9-210ENST00000564582 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 APPL1Q9UKG1 709 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 IFT52Q9Y366 437 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 MYH6P13533 1939 aa5.69□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 TNRQ92752 1358 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 A0A0G2JLW4 131 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 A0A0G2JND7 137 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 FUOMA2VDF0 154 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 MYMKA6NI61 221 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 M0QX08 132 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 FCHO1O14526 889 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 ITM2AO43736 263 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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CHD9-210ENST00000564582 KRT75O95678 551 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 MT-ND3P03897 115 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 CYP1A2P05177 515 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 TFAP2AP05549 437 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 DLDP09622 509 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 MCF2P10911 925 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 IL2RBP14784 551 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 PSMC3P17980 439 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 M6PRP20645 277 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 PROZP22891 400 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 VPS41P49754 854 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 FLT3LGP49771 235 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 COPAP53621 1224 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 ITGA8P53708 1063 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 ARL4CP56559 192 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 BTKQ06187 659 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 SP140Q13342 867 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 ITGA7Q13683 1181 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 APOFQ13790 326 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 TMED2Q15363 201 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 MAPK6Q16659 721 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 ZBED5Q49AG3 693 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 SLX4IPQ5VYV7 408 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 C16orf87Q6PH81 154 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 GPR141Q7Z602 305 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 SPRED1Q7Z699 444 aa5.68□□□□□ -1.5
CHD9-210ENST00000564582 SATL1Q86VE3 508 aa5.68□□□□□ -1.5
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