RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		21.94	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TOR1B	O14657	336 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	FFAR2	O15552	330 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	MFAP3L	O75121	409 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINB6	P35237	376 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SCNN1B	P51168	640 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL2L1	Q07817	233 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	RALGDS	Q12967	914 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	MMRN1	Q13201	1228 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	DPYSL3	Q14195	570 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ERAP2	Q6P179	960 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CHP1	Q99653	195 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	MYLK	Q15746	1914 aa		21.93	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP69	A5D8W1	941 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	NEMP2	A6NFY4	417 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKCG	P05129	697 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	LIG3	P49916	1009 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN6	P56747	220 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R40	P59535	323 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMG2	Q02383	582 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT81	Q14533	505 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	IRF4	Q15306	451 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP58	Q5T655	872 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PROSER1	Q86XN7	944 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	MGME1	Q9BQP7	344 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200		U3KQA8	63 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		21.92	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200		K7ESM1	405 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	NEBL	O76041	1014 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM253	P0C7T8	217 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CKMT1A	P12532	417 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	JUND	P17535	347 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PTK2B	Q14289	1009 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF235	Q14590	738 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC14	Q15048	493 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	RFFL	Q8WZ73	363 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	DKK4	Q9UBT3	224 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		21.91	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BM21	787 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	MAN1A1	P33908	653 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	THOP1	P52888	689 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	MACC1	Q6ZN28	852 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	FAF2	Q96CS3	445 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	APOLD1	Q96LR9	279 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF670	Q9BS34	389 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	DEF6	Q9H4E7	631 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	LRP4	O75096	1905 aa		21.9	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	AQP9	O43315	295 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD11	O43934	449 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	AKR1B10	O60218	316 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ALPPL2	P10696	532 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	GM2A	P17900	193 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX5	P50542	639 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PDK2	Q15119	407 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	HS1BP3	Q53T59	392 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	HES3	Q5TGS1	186 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	LIPI	Q6XZB0	460 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	DPPA4	Q7L190	304 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	RBFA	Q8N0V3	343 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX26	Q8N6G2	289 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	MDM1	Q8TC05	714 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TBATA	Q96M53	351 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	NOD2	Q9HC29	1040 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		21.89	■■□□□ 1.1
PPP4C-205	ENST00000563200	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SOCS5	O75159	536 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	GCAT	O75600	419 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNT2	Q10471	571 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	INPP5A	Q14642	412 aa		21.89	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		21.89	■■□□□ 1.09

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