RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562553.5

CCNDBP1-203, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 736 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-203ENST00000562553 SUOXP51687 545 aa15.49■□□□□ 0.07
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CCNDBP1-203ENST00000562553 FAM193AP78312 1265 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 DSC2Q02487 901 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
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CCNDBP1-203ENST00000562553 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.48■□□□□ 0.07
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CCNDBP1-203ENST00000562553 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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CCNDBP1-203ENST00000562553 CST8O60676 142 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 CBFA2T3O75081 653 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 KRT37O76014 449 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
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CCNDBP1-203ENST00000562553 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
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CCNDBP1-203ENST00000562553 AP1B1Q10567 949 aa15.47■□□□□ 0.07
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CCNDBP1-203ENST00000562553 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 RALGPS1Q5JS13 557 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 Q6ZSR6 202 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 CCDC50Q8IVM0 306 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 CNTD1Q8N815 330 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
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CCNDBP1-203ENST00000562553 EXD1Q8NHP7 514 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 CENPTQ96BT3 561 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 IL12RB2Q99665 862 aa15.47■□□□□ 0.07
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CCNDBP1-203ENST00000562553 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 GPR27Q9NS67 375 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 WASF3Q9UPY6 502 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 A8MX80 341 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 FPGTO14772 594 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PCDHGA12O60330 932 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 DFNA5O60443 496 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 MAGEC1O60732 1142 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PGLSO95336 258 aa15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PDHA1P08559 390 aa15.46■□□□□ 0.07
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