RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT35Q92764 455 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 PSKH2Q96QS6 385 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 DTLQ9NZJ0 730 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ADRB3P13945 408 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 CR2P20023 1033 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ABL2P42684 1182 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 CDKN2BP42772 138 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 NEK3P51956 506 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 HS1BP3Q53T59 392 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 TSGA13Q96PP4 275 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 PREBQ9HCU5 417 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 DYRK4Q9NR20 520 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 AK5Q9Y6K8 562 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 PIGNO95427 931 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 BNIP3Q12983 259 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 RTP5Q14D33 572 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 HES3Q5TGS1 186 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 NEK5Q6P3R8 708 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 DAAM2Q86T65 1068 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1328Q86T90 577 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 SRLQ86TD4 932 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 TEX26Q8N6G2 289 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 MAML1Q92585 1016 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 DKK3Q9UBP4 350 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 SEPT3Q9UH03 358 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ASXL3Q9C0F0 2248 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 TSPAN11A1L157 253 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 AREL1O15033 823 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 AP1G1O43747 822 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 TIMP2P16035 220 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 E2F1Q01094 437 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ADCY2Q08462 1091 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF284Q2VY69 593 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 FATE1Q969F0 183 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 KLHDC7BQ96G42 594 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 GGT7Q9UJ14 662 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A1W2PQU0 124 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ITIH2P19823 946 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ACP1P24666 158 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 SEMG2Q02383 582 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 RAD51Q06609 339 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 NPNTQ6UXI9 565 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 HORMAD1Q86X24 394 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 OLFM3Q96PB7 478 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 MGME1Q9BQP7 344 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ITM2BQ9Y287 266 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 MATN3O15232 486 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT10P13645 584 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CCNCP24863 283 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PEX5P50542 639 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CCZ1BP86790 482 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 FGL2Q14314 439 aa20.19■□□□□ 0.82
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