RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555905.5

TMEM260-208, Transcript of transmembrane protein 260, human

TSL 5

Gene TMEM260, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM260-208	ENST00000555905	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	DYNC1I1	O14576	645 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	FZD6	O60353	706 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PRL	P01236	227 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	IL1B	P01584	269 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	CTSL	P07711	333 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PDHA1	P08559	390 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	CHRNB1	P11230	501 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PMS2	P54278	862 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	QPCT	Q16769	361 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	MSS51	Q4VC12	460 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	RELL1	Q8IUW5	271 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	CCNJL	Q8IV13	435 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	FAM129B	Q96TA1	746 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	NAT9	Q9BTE0	207 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	DYRK4	Q9NR20	520 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	SYBU	Q9NX95	663 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	DKK3	Q9UBP4	350 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	TSPAN11	A1L157	253 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ADAM23	O75077	832 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ATG13	O75143	517 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	BANF1	O75531	89 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	CRTAM	O95727	393 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ADH1B	P00325	375 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ADRA1D	P25100	572 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ITGB7	P26010	798 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ELK3	P41970	407 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PSMD8	P48556	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	EMP3	P54852	163 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	CRADD	P78560	199 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ZXDA	P98168	799 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	SEPT6	Q14141	434 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	POU6F1	Q14863	301 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PCID2	Q5JVF3	399 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	USP45	Q70EL2	814 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PALM2	Q8IXS6	379 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	MPP5	Q8N3R9	675 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	OR2T3	Q8NH03	318 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM260-208	ENST00000555905	RANBP9	Q96S59	729 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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