RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 HECTD1Q9ULT8 2610 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A1B0GVT2 93 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PRRT4C9JH25 899 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 MFSD11O43934 449 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ERCC2P18074 760 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TPSB2P20231 275 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP5DP30049 168 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CCR1P32246 355 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SEMG2Q02383 582 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 RASA2Q15283 850 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TPSAB1Q15661 275 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 C9orf72Q96LT7 481 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 FETUBQ9UGM5 382 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 E7EVH7 732 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM72CH0Y354 149 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM63AO94886 807 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC2A3P11169 496 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 OXTRP30559 389 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SERPINB6P35237 376 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 HNF1BP35680 557 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 FDFT1P37268 417 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CDK16Q00536 496 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM72BQ86X60 149 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TDRPQ86YL5 185 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF276Q8N554 614 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CENPHQ9H3R5 247 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 NMUR1Q9HB89 426 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 GMIPQ9P107 970 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 AK5Q9Y6K8 562 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM131Q92545 1883 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SPTA1P02549 2419 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 MGAQ8IWI9 3026 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A1W2PQH9 124 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 WASH3PC4AMC7 463 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ERVH48-1M5A8F1 160 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 MTSS1O43312 755 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 COCHO43405 550 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHGA12O60330 932 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CACNG3O60359 315 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 JUPP14923 745 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 MX2P20592 715 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 YWHAQP27348 245 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP2R2AP63151 447 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SEMA5AQ13591 1074 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 LURAP1LQ8IV03 231 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF34Q969K3 372 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC39Q96DD0 335 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SPATA13Q96N96 652 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ATMQ13315 3056 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 CDH16O75309 829 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SPAG6O75602 509 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PHBP35232 272 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 LMAN1P49257 510 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 TPMTP51580 245 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 MTA1Q13330 715 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 STARD3Q14849 445 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 RTP5Q14D33 572 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 KIF19Q2TAC6 998 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 FUT11Q495W5 492 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 MANEALQ5VSG8 457 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC39A13Q96H72 371 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 C1orf74Q96LT6 269 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-204ENST00000548823 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms