RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544432.5

VAMP1-208, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, human

TSL 3

Gene VAMP1, Length 759 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAMP1-208	ENST00000544432	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	OR4C6	Q8NH72	309 aa		14.02	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		14.02	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	RFFL	Q8WZ73	363 aa		14.02	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	TBATA	Q96M53	351 aa		14.02	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	TSGA13	Q96PP4	275 aa		14.02	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		14.02	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		14.02	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	IGF2R	P11717	2491 aa		14.02	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	CACNA1B	Q00975	2339 aa		14.02	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	NEMP2	A6NFY4	417 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	SCAMP1	O15126	338 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	GIMD1	P0DJR0	217 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	CKMT2	P17540	419 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	MX2	P20592	715 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	CES1	P23141	567 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	IGFALS	P35858	605 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	SLC1A1	P43005	524 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	MMP13	P45452	471 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	LIG3	P49916	1009 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	MESD	Q14696	234 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	LRRC14	Q15048	493 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	ST3GAL2	Q16842	350 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	LRRC38	Q5VT99	294 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	TC2N	Q8N9U0	490 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	MAML1	Q92585	1016 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	AMACR	Q9UHK6	382 aa		14.01	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432		H3BM21	787 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	TRIM38	O00635	465 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	MATN3	O15232	486 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	SDC3	O75056	442 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	RFPL3	O75679	317 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	ALPPL2	P10696	532 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	C6	P13671	934 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	KDELR1	P24390	212 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	ACP1	P24666	158 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	CCNC	P24863	283 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	ACADVL	P49748	655 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	HS1BP3	Q53T59	392 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	LIPI	Q6XZB0	460 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	DPPA4	Q7L190	304 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	PQLC3	Q8N755	202 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	RAPGEF5	Q92565	580 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	RNF157	Q96PX1	679 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	USP29	Q9HBJ7	922 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	NOD2	Q9HC29	1040 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		14	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	SIGLEC6	O43699	453 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	MFSD11	O43934	449 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	LCA5L	O95447	670 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	NFKBIA	P25963	317 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	GJC1	P36383	396 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	THOP1	P52888	689 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	RALGDS	Q12967	914 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	DNAJC3	Q13217	504 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	MTM1	Q13496	603 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	IRF4	Q15306	451 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	MACC1	Q6ZN28	852 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	KLF15	Q9UIH9	416 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		13.99	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		13.98	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	TPP1	O14773	563 aa		13.98	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	CAPNS1	P04632	268 aa		13.98	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	ELFN1	P0C7U0	828 aa		13.98	□□□□□ -0.17
VAMP1-208	ENST00000544432	CKMT1A	P12532	417 aa		13.98	□□□□□ -0.17

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