RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534401.5

PKP3-211, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-211ENST00000534401 NEMP1O14524 444 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 GIPC1O14908 333 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 SH3BP5O60239 455 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 MMP20O60882 483 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 CCT8P50990 548 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 COPS2P61201 443 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 MAXP61244 160 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 ADCY2Q08462 1091 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 TRAF2Q12933 501 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 RALGDSQ12967 914 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 SGCGQ13326 291 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 PDK1Q15118 436 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 PPP2R5EQ16537 467 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 RFX6Q8HWS3 928 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 OXR1Q8N573 874 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 CNTD1Q8N815 330 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 DEFB124Q8NES8 71 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 IFT43Q96FT9 208 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 ADGRG1Q9Y653 693 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 A0A0U1RQJ8 604 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 YKT6O15498 198 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 TM7SF2O76062 418 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 THEGLP0DJG4 465 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 TNNT1P13805 278 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 PTPN7P35236 360 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 CLDN2P57739 230 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 PFN3P60673 137 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 NPNTQ6UXI9 565 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 DPPA4Q7L190 304 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 GLRX5Q86SX6 157 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 NAXDQ8IW45 347 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 OR13H1Q8NG92 308 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 CXorf40AQ8TE69 158 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 SAP25Q8TEE9 199 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 SEMA3CQ99985 751 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 DESI2Q9BSY9 194 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 SLC32A1Q9H598 525 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 HEY1Q9Y5J3 304 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 CCDC66A2RUB6 948 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 A6NNZ2 444 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 TOR1BO14657 336 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 FLRT2O43155 660 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 CST8O60676 142 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 PGLSO95336 258 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 HLA-DQB2P05538 268 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 ADRB1P08588 477 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 KRT10P13645 584 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 TGM2P21980 687 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 XPAP23025 273 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 NIPAL4Q0D2K0 466 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 KIF5AQ12840 1032 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 ERAP2Q6P179 960 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 LIPIQ6XZB0 460 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 BBS12Q6ZW61 710 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 KIAA1328Q86T90 577 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 LRRN4Q8WUT4 740 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 PIH1D2Q8WWB5 315 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 ARHGAP6O43182 974 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 JCHAINP01591 159 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 MMP2P08253 660 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 GM2AP17900 193 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 IGFALSP35858 605 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 LIG3P49916 1009 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 ODF2Q5BJF6 829 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 CFAP58Q5T655 872 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 Q6ZSR6 202 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 CCNYQ8ND76 341 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 TADA1Q96BN2 335 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 SCRN2Q96FV2 425 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 CAMK1GQ96NX5 476 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 MYOCQ99972 504 aa21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PKP3-211ENST00000534401 TRIM10Q9UDY6 481 aa21.47■■□□□ 1.03
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