RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 KLHDC7BQ96G42 594 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 IL12RB2Q99665 862 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 FZD3Q9NPG1 666 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 GDF3Q9NR23 364 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.12■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 KCNK1O00180 336 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 MMP20O60882 483 aa22.11■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 HLA-DQB2P05538 268 aa22.11■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 PEX5P50542 639 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 FAM193AP78312 1265 aa22.11■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.11■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.11■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 CA5BQ9Y2D0 317 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 FPGTO14772 594 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 TM4SF5O14894 197 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 FTCDO95954 541 aa22.1■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 MMP12P39900 470 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 NXPH1P58417 271 aa22.1■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 FGL2Q14314 439 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 OXR1Q8N573 874 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.1■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa22.1■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 THEGLP0DJG4 465 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 CCT8P50990 548 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 DSC2Q02487 901 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 ADCY2Q08462 1091 aa22.09■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 SLC32A1Q9H598 525 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 IL21RQ9HBE5 538 aa22.09■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 H0Y8X5 98 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 KCNK3O14649 394 aa22.08■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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PTPRK-222ENST00000532751 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa22.08■■□□□ 1.13
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