RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 OGFRQ9NZT2 677 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 VPS18Q9P253 973 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC17A6Q9P2U8 582 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM159BA6NKW6 160 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM155BO75949 473 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ERVK-10P10266 1014 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF366Q8N895 744 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CYTH2Q99418 400 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 TBK1Q9UHD2 729 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A0U1RQS6 177 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 AURKAO14965 403 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF40O75150 1001 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 IGSF6O95976 241 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 GSRP00390 522 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 FGF1P05230 155 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 STX2P32856 288 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 BPTFQ12830 3046 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 GPS2Q13227 327 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 QPCTQ16769 361 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PGM2Q96G03 612 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SHDQ96IW2 340 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 MROH6A6NGR9 719 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 LDB2O43679 373 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC34A2O95436 690 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ZXDAP98168 799 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PRKCQQ04759 706 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 SEPT6Q14141 434 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PTPRCAPQ14761 206 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 TERB1Q8NA31 727 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PTPRN2Q92932 1015 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 RMDN1Q96DB5 314 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 RANBP9Q96S59 729 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PAFAH2Q99487 392 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 TREX1Q9NSU2 369 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-209ENST00000532457 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 MAN2B1O00754 1011 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 DCXO43602 365 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 PGLSO95336 258 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 ALADP13716 330 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 ARNTP27540 789 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 CTHP32929 405 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 CNGA3Q16281 694 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 TDRPQ86YL5 185 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 PPM1NQ8N819 430 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 ARL5AQ9Y689 179 aa22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 ASLP04424 464 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 F7P08709 466 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 GALK1P51570 392 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 BCL2L1Q07817 233 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 EMC10Q5UCC4 262 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT222Q8N1A0 295 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-209ENST00000532457 TLCD1Q96CP7 247 aa22.07■■□□□ 1.12
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