RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GANCQ8TET4 914 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIH1D2Q8WWB5 315 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC39Q96DD0 335 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMIM14Q96QK8 99 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD320Q9NPF0 282 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SARDHQ9UL12 918 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC78A2IDD5 438 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HEATR9A2RTY3 570 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2orf81A6NN90 581 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 E7ESA3 106 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADAM23O75077 832 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATG13O75143 517 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACSL3O95573 720 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRTAMO95727 393 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC4A1P02730 911 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POLBP06746 335 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALPIP09923 528 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGAM1P18669 254 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADRA1DP25100 572 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NFKBIAP25963 317 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PHBP35232 272 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HNF1BP35680 557 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GRIA4P48058 902 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM193AP78312 1265 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZXDAP98168 799 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEMG2Q02383 582 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTPRRQ15256 657 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERAP2Q6P179 960 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CES3Q6UWW8 571 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP45Q70EL2 814 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CACUL1Q86Y37 369 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCNJLQ8IV13 435 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FLCNQ8NFG4 579 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2T3Q8NH03 318 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARRDC3Q96B67 414 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTC25Q96NG3 672 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAT9Q9BTE0 207 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOXQ1Q9C009 403 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HACD3Q9P035 362 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DKK3Q9UBP4 350 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDH23Q9H251 3354 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0J9YYE9 177 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PQF6 199 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLK4O00444 970 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NEMP1O14524 444 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MID1O15344 667 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTC4O95801 387 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADH1BP00325 375 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRBC1P01850 177 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNTTP04053 509 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSHRP16473 764 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COL9A1P20849 921 aa8.54□□□□□ -1.04
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