RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP42A6NI28 874 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 KLK10O43240 276 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 TEX33O43247 280 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 TCEA3O75764 348 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PALMO75781 387 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 C1QL1O75973 258 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 RGRP47804 291 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 C19orf57Q0VDD7 668 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 NFATC4Q14934 902 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 BROXQ5VW32 411 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ERAP2Q6P179 960 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 FOXR1Q6PIV2 292 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 BRAT1Q6PJG6 821 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ENPP7Q6UWV6 458 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 SRLQ86TD4 932 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PCDH19Q8TAB3 1148 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 SLC46A1Q96NT5 459 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 GBP4Q96PP9 640 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 APOOQ9BUR5 198 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 EDEM3Q9BZQ6 932 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 CPNE5Q9HCH3 593 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PARVAQ9NVD7 372 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PCSK1NQ9UHG2 260 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 OR1A2Q9Y585 309 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 BPTFQ12830 3046 aa17.05■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PMS2P1A4D2B8 440 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 DAPK3O43293 454 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 RASGRP1O95267 797 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PCCBP05166 539 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 HTR1BP28222 390 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 MMP12P39900 470 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 CSNK1DP48730 415 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 SRP54P61011 504 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 SPIDRQ14159 915 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 AGERQ15109 404 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ERMARDQ5T6L9 678 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 IGF2-ASQ6U949 168 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 AOPEPQ8N6M6 819 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ARL10Q8N8L6 244 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 WDR48Q8TAF3 677 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PEBP4Q96S96 227 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 SIRPGQ9P1W8 387 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 MYO6Q9UM54 1294 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa17.04■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 LRRK1Q38SD2 2015 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 DFFAO00273 331 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ALPIP09923 528 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ERCC2P18074 760 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 SERPINA4P29622 427 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PDX1P52945 283 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 UCNP55089 124 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 TMPRSS3P57727 454 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 AFMIDQ63HM1 303 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 KCTD16Q68DU8 428 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 LVRNQ6Q4G3 990 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PCSK4Q6UW60 755 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 RFX8Q6ZV50 586 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 KYQ8NBH2 561 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 WDR92Q96MX6 357 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 DPH1Q9BZG8 443 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 TRIM7Q9C029 511 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 SP110Q9HB58 689 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 KLQ9UEF7 1012 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 GPR34Q9UPC5 381 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 RP1P56715 2156 aa17.03■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 TMEM191CA6NGB0 347 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 LRRC53A6NM62 1247 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PRPSAP2O60256 369 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 MIPP30301 263 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 RALGDSQ12967 914 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 MTM1Q13496 603 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP40Q5TG30 622 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 GKN2Q86XP6 184 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 NPWQ8N729 165 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G15Q8NCC3 412 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 ATL2Q8NHH9 583 aa17.02■□□□□ 0.32
HERC3-211ENST00000513325 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms