RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT81	Q14533	505 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGER	Q15109	404 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRF4	Q15306	451 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHRS13	Q6UX07	377 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEX26	Q8N6G2	289 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TC2N	Q8N9U0	490 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR4C6	Q8NH72	309 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAPGEF5	Q92565	580 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF670	Q9BS34	389 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRP4	O75096	1905 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM149A	A5PLN7	773 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAF4	O00268	1085 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	AKR1B10	O60218	316 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEBL	O76041	1014 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERPINB6	P35237	376 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIG3	P49916	1009 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAX	P61244	160 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	BCL2L1	Q07817	233 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELP6	Q0PNE2	266 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	GALNT2	Q10471	571 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAF2	Q12933	501 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCEAL1	Q15170	157 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCTD16	Q68DU8	428 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARG	Q86W56	976 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAML1	Q92585	1016 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEF6	Q9H4E7	631 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOD2	Q9HC29	1040 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	APC2	O95996	2303 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP69	A5D8W1	941 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCAMP1	O15126	338 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	FFAR2	O15552	330 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFPL3	O75679	317 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1S	P09871	688 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYF5	P13349	255 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CKMT2	P17540	419 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	KDELR1	P24390	212 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACP1	P24666	158 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	RENBP	P51606	427 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	YPEL5	P62699	121 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	GBE1	Q04446	702 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF235	Q14590	738 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MESD	Q14696	234 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDK2	Q15119	407 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPRR	Q15256	657 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC157	Q569K6	752 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIPI	Q6XZB0	460 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPPA4	Q7L190	304 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNGA4	Q8IV77	575 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBFA	Q8N0V3	343 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PELI3	Q8N2H9	469 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCTD6	Q8NC69	237 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC42	Q96M95	316 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSGA13	Q96PP4	275 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBSN	Q9H1K0	784 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHD6	Q8TD26	2715 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYLK	Q15746	1914 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014		K7ESM1	405 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	FZD6	O60353	706 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOCS5	O75159	536 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	GCAT	O75600	419 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT7	P08729	469 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	JUND	P17535	347 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMP13	P45452	471 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC14	Q15048	493 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	MARC1	Q5VT66	337 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERAP2	Q6P179	960 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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