RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511145.1

FAM13A-215, Transcript of family with sequence similarity 13 member A, human

TSL 3

Gene FAM13A, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM13A-215	ENST00000511145	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	LAMA5	O15230	3695 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	KNL1	Q8NG31	2342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145		A0A087WV48	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145		A0A1W2PR48	441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	MYMK	A6NI61	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	PIGR	P01833	764 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	APOD	P05090	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	HDC	P19113	662 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	CLDN6	P56747	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	TSPY1	Q01534	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	BNC1	Q01954	994 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	OCRL	Q01968	901 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	TRIM29	Q14134	588 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145		K7ENM7	598 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	TULP3	O75386	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	RFPL3	O75679	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	OLFM2	O95897	454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	HOXB2	P14652	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	ITGB6	P18564	788 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	BDNF	P23560	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	LMO2	P25791	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	ADSS	P30520	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	DPP6	P42658	865 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	TNFRSF4	P43489	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	ABCG1	P45844	678 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	SLC7A9	P82251	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	MGAT5	Q09328	741 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-215	ENST00000511145	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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