RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
TIMMDC1-209ENST00000498399 HSF4Q9ULV5 492 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMMDC1-209ENST00000498399 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMC3Q9UQE7 1217 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMMDC1-209ENST00000498399 MROH5Q6ZUA9 1318 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMMDC1-209ENST00000498399 TCHHQ07283 1943 aa4.4□□□□□ -1.7
TIMMDC1-209ENST00000498399 DISP2A7MBM2 1401 aa4.4□□□□□ -1.7
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 H3BNX3 289 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 STX6O43752 255 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 USP12O75317 370 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SGPL1O95470 568 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NTN1O95631 604 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD63P08962 238 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SYT1P21579 422 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRKCHP24723 683 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 GSTM2P28161 218 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 AVPR2P30518 371 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 RFC4P35249 363 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SOX2P48431 317 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TUBP50607 506 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADPRHP54922 357 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 EIF5P55010 431 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 RETSATQ6NUM9 610 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTFR2Q6P444 385 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLEC4GQ6UXB4 293 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATG9AQ7Z3C6 839 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF144BQ7Z419 303 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 MDGA2Q7Z553 956 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TICAM2Q86XR7 235 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNFT2Q96EX2 444 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 P2RY11Q96G91 374 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NYXQ9GZU5 481 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 IL25Q9H293 177 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACAD9Q9H845 621 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC22A11Q9NSA0 550 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 HMG20BQ9P0W2 317 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TBX20Q9UMR3 447 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTMR6Q9Y217 621 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 PKP3Q9Y446 797 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SQORQ9Y6N5 450 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 C5P01031 1676 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 KAT6BQ8WYB5 2073 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCPQ6ZWJ8 1503 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC171Q6TFL3 1326 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 LTBP4Q8N2S1 1624 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ABCA3Q99758 1704 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A0D9SFI3 127 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYMKA6NI61 221 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMTNL1A8MU46 457 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 UGDHO60701 494 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 IDH1O75874 414 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC192P0DO97 292 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 PSG1P11464 419 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARSAP15289 507 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 RPS6KB1P23443 525 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.39□□□□□ -1.713e-7■■■□□ 16.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 ELF1P32519 619 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRT9P35527 623 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ME1P48163 572 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 MVDP53602 400 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARHGAP8P85298 464 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRDNQ13061 729 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ITPK1Q13572 414 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 LAMB3Q13751 1172 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NECTIN1Q15223 517 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPR68Q15743 365 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NFIL3Q16649 462 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 CAVIN4Q5BKX8 364 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 C10orf76Q5T2E6 689 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 TAF3Q5VWG9 929 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC30A9Q6PML9 568 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 DEF8Q6ZN54 512 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 RTL10Q7L3V2 364 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 GALNT7Q86SF2 657 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM47BQ8NA70 645 aa4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98 ms