RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 JADE1Q6IE81 842 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 RBFAQ8N0V3 343 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 DPF1Q92782 380 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MXD3Q9BW11 206 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TEX12Q9BXU0 123 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0U1RQF3 1178 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 P4HA2O15460 535 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 HCRTR2O43614 444 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 GJB3O75712 270 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 NR2F1P10589 423 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ETFAP13804 333 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TFAP4Q01664 338 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF6Q15052 776 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 USP41Q3LFD5 358 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CEP76Q8TAP6 659 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM184CQ9NVA4 438 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 WIPF3A6NGB9 483 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CDRT15L2A8MXV6 281 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 STMND1H3BQB6 276 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 KLKB1P03952 638 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 AGAP20933 346 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SAT1P21673 171 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SHMT1P34896 483 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 AVPR1AP37288 418 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP25P42331 645 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PIK3CAP42336 1068 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CDH12P55289 794 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 FAM27E3Q08E93 113 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CAPSQ13938 189 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 IRF3Q14653 427 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 LPIN1Q14693 890 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ADIPOQQ15848 244 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ESCO2Q56NI9 601 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF6Q58WW2 860 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 LCTLQ6UWM7 567 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 LHPPQ9H008 270 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MORF4L1Q9UBU8 362 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 BTBD18B2RXH4 712 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 IFNL4K9M1U5 179 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 NKX2-2O95096 273 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ZBED6P86452 979 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 BEST2Q8NFU1 509 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM47Q9BQJ4 181 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL31Q9H511 634 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JK05 382 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 E5RJQ4 531 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 HS6ST1O60243 411 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 KLK8O60259 260 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PGM3O95394 542 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN7O95471 211 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MMP2P08253 660 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNB1P11230 501 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 GABRB1P18505 474 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 MYF6P23409 242 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CHATP28329 748 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 CXCR3P49682 368 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TMPRSS3P57727 454 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 NAB2Q15742 525 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TRILQ7L0X0 811 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 LINGO2Q7L985 606 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 HACE1Q8IYU2 909 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TEX45Q8NA69 505 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM18Q96B42 140 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-212ENST00000491302 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
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