RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491123.5

SUCLG1-208, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 1,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-208	ENST00000491123	ITGA2	P17301	1181 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ABCC9	O60706	1549 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	RGS11	O94810	467 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	STX2	P32856	288 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	DVL1	O14640	695 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	RASA4	O43374	803 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SERPINC1	P01008	464 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SERPINA4	P29622	427 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	CHRNB4	P30926	498 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARSF	P54793	590 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATF3	P18847	181 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	DCT	P40126	519 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123		A0A0J9YWU9	116 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	PMM2	O15305	246 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	TM4SF4	P48230	202 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	HDAC4	P56524	1084 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	RND1	Q92730	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	APAF1	O14727	1248 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	METTL18	O95568	372 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SRD5A1	P18405	259 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms