RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 PEX6Q13608 980 aa2.6□□□□□ -1.99
CACNA2D1-211ENST00000486539 PMS2P11Q13670 270 aa2.6□□□□□ -1.99
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRBA2Q6ZNG9 492 aa2.6□□□□□ -1.99
CACNA2D1-211ENST00000486539 RINLQ6ZS11 566 aa2.6□□□□□ -1.99
CACNA2D1-211ENST00000486539 MON1AQ86VX9 555 aa2.6□□□□□ -1.99
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CACNA2D1-211ENST00000486539 ZFP69Q49AA0 526 aa2.57□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa2.57□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR73Q6P4I2 378 aa2.57□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa2.57□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 GATAD2AQ86YP4 633 aa2.57□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 HERC6Q8IVU3 1022 aa2.57□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 C11orf53Q8IXP5 236 aa2.57□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
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CACNA2D1-211ENST00000486539 CYSLTR2Q9NS75 346 aa2.57□□□□□ -2
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CACNA2D1-211ENST00000486539 TNFAIP2Q03169 654 aa2.56□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 RUNX1T1Q06455 604 aa2.56□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 ME3Q16798 604 aa2.56□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR63Q8IWG1 891 aa2.56□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC20A1Q8WUM9 679 aa2.56□□□□□ -2
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPM1EQ8WY54 764 aa2.56□□□□□ -2
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