RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	RNF38	Q9H0F5	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261		F8W810	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PPEF2	O14830	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CLDN11	O75508	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PML	P29590	882 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CD6	P30203	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CCT8	P50990	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	BLK	P51451	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CCR9	P51686	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TCF15	Q12870	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CRY1	Q16526	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	BROX	Q5VW32	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SCML4	Q8N228	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261		A0A1W2PQH9	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	AGRP	O00253	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ERBB2	P04626	1255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC130	P13994	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ARSA	P15289	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ITGA8	P53708	1063 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	STX17	P56962	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	E2F1	Q01094	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DR1	Q01658	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GBE1	Q04446	702 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	GRIN1	Q05586	938 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PNOC	Q13519	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	STK11	Q15831	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	STX12	Q86Y82	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	IL21	Q9HBE4	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	LCT	P09848	1927 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC25A17	O43808	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TBL1X	O60907	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	PFDN1	O60925	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	CIB2	O75838	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	ITGAV	P06756	1048 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KRIT1-222	ENST00000486261	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	1e-12	■■■■□ 21.8

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