RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 SEPT8Q92599 483 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 LRRC39Q96DD0 335 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 CEP170P1Q96L14 293 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 DACH2Q96NX9 599 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ASB2Q96Q27 587 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 KIFC1Q9BW19 673 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ZNF221Q9UK13 617 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 DENND3A2RUS2 1198 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 OR5K4A6NMS3 321 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CENPXA8MT69 81 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PSMD11O00231 422 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TRIM38O00635 465 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ACOT8O14734 319 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CLDN3O15551 220 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TMCC2O75069 709 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 UGT2B11O75310 529 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 INHBAP08476 426 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MYL3P08590 195 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GSTM1P09488 218 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FCGR1AP12314 374 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CDH1P12830 882 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GFAPP14136 432 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ABCB4P21439 1286 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GSTM2P28161 218 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TYK2P29597 1187 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GNPDA1P46926 289 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ID4P47928 161 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MAPKAPK2P49137 400 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FMO5P49326 533 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 HARS2P49590 506 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TNP2Q05952 138 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TRAF2Q12933 501 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FOXC1Q12948 553 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 INPP5AQ14642 412 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MESDQ14696 234 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ACAP1Q15027 740 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CALCRLQ16602 461 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLC36A3Q495N2 470 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CEP55Q53EZ4 464 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ESCO2Q56NI9 601 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 BROXQ5VW32 411 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SPRYD7Q5W111 196 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GALNT7Q86SF2 657 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 HPS6Q86YV9 775 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LGI2Q8N0V4 545 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PDIK1LQ8N165 341 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SVOPQ8N4V2 548 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ATP2A3Q93084 1043 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 NCLNQ969V3 563 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLC45A3Q96JT2 553 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZNF560Q96MR9 790 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RDH12Q96NR8 316 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CNPY3Q9BT09 278 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 NUP85Q9BW27 656 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GPR88Q9GZN0 384 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.21□□□□□ -1.26
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