RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SEMG2Q02383 582 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ITKQ08881 620 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 KIF5AQ12840 1032 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TRAF2Q12933 501 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TFDP2Q14188 446 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 IHHQ14623 411 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PDK1Q15118 436 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SHBQ15464 509 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TFDP3Q5H9I0 405 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 KAZNQ674X7 775 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 OR13H1Q8NG92 308 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CENPTQ96BT3 561 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SEMA3CQ99985 751 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ADGRG1Q9Y653 693 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 POM121BA6NF01 834 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 KCNK1O00180 336 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TM7SF2O76062 418 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 JCHAINP01591 159 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DQB2P05538 268 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CEACAM1P13688 526 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PEX5P50542 639 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CCT8P50990 548 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 DENND6BQ8NEG7 585 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ARRDC2Q8TBH0 407 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 FAM174AQ8TBP5 190 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CAMK1GQ96NX5 476 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 IL12RB2Q99665 862 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SLC32A1Q9H598 525 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PCNX2A6NKB5 2137 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQ67 120 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA12O60330 932 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CES1P23141 567 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 NR2C2P49116 596 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 FAM193AP78312 1265 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 IL9RQ01113 521 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 DSC2Q02487 901 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 NIPAL4Q0D2K0 466 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 AP1B1Q10567 949 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 RALGDSQ12967 914 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB17Q13105 803 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R5EQ16537 467 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 FAM182AQ5T1J6 154 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZSR6 202 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CNTD1Q8N815 330 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 GPR27Q9NS67 375 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TMEM131Q92545 1883 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 CCDC66A2RUB6 948 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 CFAP69A5D8W1 941 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 A6NNZ2 444 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 FPGTO14772 594 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP6O43182 974 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 FZD6O60353 706 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 CBFA2T3O75081 653 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 PGLSO95336 258 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 C6P13671 934 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 TGM2P21980 687 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 KCNA4P22459 653 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 RXRGP48443 463 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 LIG3P49916 1009 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 DPPA4Q7L190 304 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 NAXDQ8IW45 347 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 PAF1Q8N7H5 531 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD36A6QL64 1941 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 NEBLO76041 1014 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 CPP00450 1065 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 RWDD2BP57060 319 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 COPS2P61201 443 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 AGERQ15109 404 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-211ENST00000480301 ARMC12Q5T9G4 340 aa21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms