RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC14Q49A88 953 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 COLEC12Q5KU26 742 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 MACC1Q6ZN28 852 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 VASH2Q86V25 355 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 WDR48Q8TAF3 677 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 SGF29Q96ES7 293 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 TBATAQ96M53 351 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 APOOQ9BUR5 198 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 LRRN3Q9H3W5 708 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 STARD5Q9NSY2 213 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 PISDQ9UG56 409 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 OR12D3Q9UGF7 316 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 GPR34Q9UPC5 381 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 NEU3Q9UQ49 428 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 BSNQ9UPA5 3926 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-208ENST00000479480 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SUV39H1O43463 412 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 BUB1O43683 1085 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 LRIG2O94898 1065 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 MMEP08473 750 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CTSEP14091 401 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RHOQP17081 205 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SCNN1AP37088 669 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SCTRP47872 440 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SRP54P61011 504 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 INPP5AQ14642 412 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CLCA4Q14CN2 919 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CYTH1Q15438 398 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CDO1Q16878 200 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ARL10Q8N8L6 244 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 GPR156Q8NFN8 814 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 GPT2Q8TD30 523 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 RXFP2Q8WXD0 754 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 USP7Q93009 1102 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 MAGEH1Q9H213 219 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 OR1A2Q9Y585 309 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.52□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM202A6NGA9 273 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 C9orf172C9J069 976 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 D6RAR5 112 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 NVLO15381 856 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 B4GAT1O43505 415 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PRAMEF10O60809 474 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 TMCC1O94876 653 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PIGNO95427 931 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PRKCGP05129 697 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 CCKBRP32239 447 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 MAPKAPK2P49137 400 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 PEX5P50542 639 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 BPIFB4P59827 614 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 B4GALNT1Q00973 533 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC14Q15048 493 aa8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTPS1-208ENST00000479480 ELOCQ15369 112 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms