RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	RAB10	P61026	200 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	SPRED2	Q7Z698	418 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF398	Q8TD17	642 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	ACD	Q96AP0	544 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	TBATA	Q96M53	351 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	DPP7	Q9UHL4	492 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	MID2	Q9UJV3	735 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	CCL22	O00626	93 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	TGDS	O95455	350 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	GLP2R	O95838	553 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	CRABP2	P29373	138 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	ARSD	P51689	593 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	CLCN5	P51795	746 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	LMAN2	Q12907	356 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	SETDB1	Q15047	1291 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	CLEC14A	Q86T13	490 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	C10orf82	Q8WW14	230 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	C7orf26	Q96N11	449 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	COPG2	Q9UBF2	871 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	ACOT9	Q9Y305	439 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	MYO1C	O00159	1063 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	DCTN3	O75935	186 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	APOA4	P06727	396 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	CPA3	P15088	417 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	KCNA4	P22459	653 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	POU4F1	Q01851	419 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	ACVR1	Q04771	509 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	PCLAF	Q15004	111 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	CNST	Q6PJW8	725 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	LCA5	Q86VQ0	697 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	CCL26	Q9Y258	94 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	C2orf81	A6NN90	581 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	COL6A2	P12110	1019 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	GALNT7	Q86SF2	657 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	SCYL1	Q96KG9	808 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	SAMD11	Q96NU1	681 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	TDP1	Q9NUW8	608 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	OR51F1	A6NGY5	319 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	ARHGEF15	O94989	841 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	PDHA1	P08559	390 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	EPHB1	P54762	984 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAF2	Q12933	501 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	CAMK1	Q14012	370 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A087X1B8	175 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A0G2JND7	137 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	SOBP	A7XYQ1	873 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	MOSPD3	O75425	235 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	PRL	P01236	227 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	CA3	P07451	260 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	CD70	P32970	193 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	ARFIP2	P53365	341 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	AP1S1	P61966	158 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	GPM6B	Q13491	265 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	PTPRCAP	Q14761	206 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	MBLAC2	Q68D91	279 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	PAF1	Q8N7H5	531 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	THAP1	Q9NVV9	213 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		18.38	■□□□□ 0.53

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