RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.56□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 TNMDQ9H2S6 317 aa4.56□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 THSD1Q9NS62 852 aa4.56□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 GALNT8Q9NY28 637 aa4.56□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 CFAP45Q9UL16 551 aa4.56□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 CITO14578 2027 aa4.56□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.56□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 MYH11P35749 1972 aa4.56□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.55□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 K7EM74 188 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 K7ENM7 598 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 SPTLC2O15270 562 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 CUTAO60888 179 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 SDC3O75056 442 aa4.55□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 CDK4P11802 303 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 HDCP19113 662 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 ABCB4P21439 1286 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 ACP1P24666 158 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 PNPLA4P41247 253 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 STAT6P42226 847 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 IL13RA1P78552 427 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 SMARCB1Q12824 385 aa4.55□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 FHL5Q5TD97 284 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 TMEM25Q86YD3 366 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 CCDC65Q8IXS2 484 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 LSMEM2Q8N112 164 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 BIRC7Q96CA5 298 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 ACCSQ96QU6 501 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 PLIN2Q99541 437 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 KLC2Q9H0B6 622 aa4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.55□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 TMEM206Q9H813 350 aa4.55□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.55□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 RP1P56715 2156 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.54□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 A0A1B0GVM2 712 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 SLC12A8A0AV02 714 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 LACTBL1A8MY62 500 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 PIRO00625 290 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 TSPAN3O60637 253 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 FSBPO95073 299 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 TNFSF15O95150 251 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 FAM163BP0C2L3 166 aa4.54□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 NR1D1P20393 614 aa4.54□□□□□ -1.68
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CNN3-204ENST00000461018 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 TUFMP49411 452 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 COPAP53621 1224 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 LILRA4P59901 499 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 RAC3P60763 192 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 ILKQ13418 452 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 VEPH1Q14D04 833 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 ISXQ2M1V0 245 aa4.54□□□□□ -1.68
CNN3-204ENST00000461018 TM4SF20Q53R12 229 aa4.54□□□□□ -1.68
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