RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447117.1

PTENP1-201, Transcript of phosphatase and tensin homolog pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PTENP1, Length 1,215 nt, Biotype transcribed processed pseudogene, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-201ENST00000447117 GAGE12GP0CL81 117 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 GAGE12IP0CL82 117 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 AGAP20933 346 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 DSCR9P59020 149 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 GAGE1Q13065 139 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 GAGE4Q13068 117 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 ITGADQ13349 1161 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 KEAP1Q14145 624 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 TCTN1Q2MV58 587 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 SHFQ7M4L6 423 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 FJX1Q86VR8 437 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 KLHL15Q96M94 604 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 A4GNTQ9UNA3 340 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 SCINQ9Y6U3 715 aa4.55□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 TIMM23O14925 209 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 TNFSF14O43557 240 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 CH25HO95992 272 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 ETFAP13804 333 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 CCKBRP32239 447 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 CPOXP36551 454 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 EFNA5P52803 228 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 TRAF3Q13114 568 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 NEDD9Q14511 834 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 PPP2R5BQ15173 497 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 GSTA3Q16772 222 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 LINGO2Q7L985 606 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 BEST2Q8NFU1 509 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 BBS4Q96RK4 519 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 MPHOSPH8Q99549 860 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.54□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 UTYO14607 1347 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 CPED1A4D0V7 1026 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 C4orf47A7E2U8 309 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 USP17L23D6RBM5 183 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 J3KR12 359 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 ACOT8O14734 319 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 HSPA12AO43301 675 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 TGFB3P10600 412 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 DAOP14920 347 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 DDX5P17844 614 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 TNFRSF8P28908 595 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 BNC1Q01954 994 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 POU5F1BQ06416 359 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 NEXNQ0ZGT2 675 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 KIF5AQ12840 1032 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 GRIK3Q13003 919 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 ASIC2Q16515 512 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 RFFLQ8WZ73 363 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 FIZ1Q96SL8 496 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 NUF2Q9BZD4 464 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 BPIFA1Q9NP55 256 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF580Q9UK33 172 aa4.53□□□□□ -1.68
PTENP1-201ENST00000447117 LINC01553A4QN01 128 aa4.52□□□□□ -1.69
PTENP1-201ENST00000447117 LRRC53A6NM62 1247 aa4.52□□□□□ -1.69
PTENP1-201ENST00000447117 LDLRAD4O15165 306 aa4.52□□□□□ -1.69
PTENP1-201ENST00000447117 TMEM63AO94886 807 aa4.52□□□□□ -1.69
PTENP1-201ENST00000447117 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.52□□□□□ -1.69
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF12P17014 697 aa4.52□□□□□ -1.69
PTENP1-201ENST00000447117 EDN2P20800 178 aa4.52□□□□□ -1.69
PTENP1-201ENST00000447117 CDAP32320 146 aa4.52□□□□□ -1.69
PTENP1-201ENST00000447117 ELF1P32519 619 aa4.52□□□□□ -1.69
PTENP1-201ENST00000447117 PEX5P50542 639 aa4.52□□□□□ -1.69
PTENP1-201ENST00000447117 ART1P52961 327 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms