RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.11■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 PDP2Q9P2J9 529 aa16.11■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 SQORQ9Y6N5 450 aa16.11■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 TBX18O95935 607 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 UQCRBP14927 111 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 MS4A2Q01362 244 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 EFEMP1Q12805 493 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 FBXL22Q6P050 247 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 SPPL2BQ8TCT7 592 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 WDR41Q9HAD4 459 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 SP110Q9HB58 689 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 VWA7Q9Y334 891 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 PLXNA3P51805 1871 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 FAM92AA1XBS5 289 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 RBP1P09455 135 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 ACAP2Q15057 778 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 SIRPB2Q5JXA9 342 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM207Q6UWW9 146 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 CCL22O00626 93 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 EOMESO95936 686 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 S1PR4O95977 384 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 PKNOX1P55347 436 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 HMGCLL1Q8TB92 370 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 LINC01599Q8WXQ3 324 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 HDAC10Q969S8 669 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 BTN2A3PQ96KV6 586 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 DRGXA6NNA5 263 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 CFLARO15519 480 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 LDB2O43679 373 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 SLC10A3P09131 477 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 OR1G1P47890 313 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 CDKN2DP55273 166 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 C1QTNF8P60827 252 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 FLOT2Q14254 428 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 CUZD1Q86UP6 607 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 GPR152Q8TDT2 470 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 SH3RF2Q8TEC5 729 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 FAR2Q96K12 515 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 NPAS2Q99743 824 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 NOD1Q9Y239 953 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 DOCK4Q8N1I0 1966 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 VCLP18206 1134 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 PEX19P40855 299 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 KCNC1P48547 511 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 PLK1P53350 603 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 FCGRTP55899 365 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 KLC3Q6P597 504 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 KCTD3Q9Y597 815 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-202ENST00000444040 OR51F1A6NGY5 319 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 ARSAP15289 507 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 MAGEA11P43364 429 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 ALDH1A3P47895 512 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 IL10RBQ08334 325 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 MED21Q13503 144 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 ART3Q13508 389 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 OR6P1Q8NGX9 317 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 PHF21BQ96EK2 531 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 GSTO2Q9H4Y5 243 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 FIS1Q9Y3D6 152 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-202ENST00000444040 GJB3O75712 270 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms