RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 TKTL1P51854 596 aa11.66□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 CHRNB3Q05901 458 aa11.66□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 GRIK3Q13003 919 aa11.66□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 GALNT7Q86SF2 657 aa11.66□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 ULK2Q8IYT8 1036 aa11.66□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 FAM84AQ96KN4 292 aa11.66□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 ATXN3LQ9H3M9 355 aa11.66□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa11.66□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 SORCS3Q9UPU3 1222 aa11.66□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 TP73O15350 636 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 F8A1P23610 371 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 PSMB9P28065 219 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 MAGEA2P43356 314 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 CHN2P52757 468 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 ACVR2BQ13705 512 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 C19orf18Q8NEA5 215 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 VAV3Q9UKW4 847 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 CLEC4AQ9UMR7 237 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 ADCY6O43306 1168 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 PEX1O43933 1283 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 ME2P23368 584 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 KLRC2P26717 231 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 NOMO3P69849 1222 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 NCF4Q15080 339 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 KPNA5O15131 536 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 NUDT7P0C024 238 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 FGFR3P22607 806 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 GSCP56915 257 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 SMU1Q2TAY7 513 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 DSG4Q86SJ6 1040 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 PSKH2Q96QS6 385 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 HMG20AQ9NP66 347 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 PLA2G4CQ9UP65 541 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 A0A087WZ62 844 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 HAT1O14929 419 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 HLA-DQA2P01906 255 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 MGAT1P26572 445 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 GTF2A2P52657 109 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 C16orf72Q14CZ0 275 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 NR6A1Q15406 480 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 VPS72Q15906 364 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 AGKQ53H12 422 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 PITRM1Q5JRX3 1037 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 NIPA1Q7RTP0 329 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 RELTQ969Z4 430 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 POLR1DQ9Y2S0 133 aa11.65□□□□□ -0.54
CCBE1-202ENST00000439986 A0A096LPK6 155 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 CDH8P55286 799 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 PKNOX1P55347 436 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 PDK3Q15120 406 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 FGD3Q5JSP0 725 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 UBXN11Q5T124 520 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 ZFP1Q6P2D0 407 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 FBXO42Q6P3S6 717 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 PLEKHH3Q7Z736 793 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 SPPL2AQ8TCT8 520 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 MARK4Q96L34 752 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 TBCBQ99426 244 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 NUDT5Q9UKK9 219 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 PACSIN3Q9UKS6 424 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.65□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 GRK4P32298 578 aa11.64□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 PRKAA1Q13131 559 aa11.64□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM53Q6P2H8 277 aa11.64□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 NPNTQ6UXI9 565 aa11.64□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 TPGS1Q6ZTW0 290 aa11.64□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 COMTD1Q86VU5 262 aa11.64□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 CEP97Q8IW35 865 aa11.64□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CCBE1-202ENST00000439986 RRAGCQ9HB90 399 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms