RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.84□□□□□ -1.47
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.84□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A1W2PQD8 194 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTMR11A4FU01 709 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ENO4A6NNW6 628 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LACTBL1A8MY62 500 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 E9PAM4 449 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AURKAO14965 403 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYN3O14994 580 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASAP2O43150 1006 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAPPC3O43617 180 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTP4A3O75365 173 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALDH1A2O94788 518 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM63AO94886 807 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDHA1P08559 390 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 QDPRP09417 244 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GABRG2P18507 467 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATF6P18850 670 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CR2P20023 1033 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFNAR2P48551 515 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALDH9A1P49189 494 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VAMP2P63027 116 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SP140Q13342 867 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTF1Q14872 753 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDGFRLQ15198 375 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SURF1Q15526 300 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF77Q15935 545 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 XKR9Q5GH70 373 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC183Q5T5S1 534 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TXNDC8Q6A555 127 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPNTQ6UXI9 565 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GBP6Q6ZN66 633 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP49Q70CQ1 688 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP53Q70EK8 1073 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RABEPKQ7Z6M1 372 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRC49Q8IUZ0 686 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CPOQ8IVL8 374 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATAD1Q8NBU5 361 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DENND6BQ8NEG7 585 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ETNPPLQ8TBG4 499 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CREB3L4Q8TEY5 395 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFAND2BQ8WV99 257 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCP11Q8WWU5 503 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EXOC4Q96A65 974 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MVB12AQ96EY5 273 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM237Q96Q45 408 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LXNQ9BS40 222 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNMDQ9H2S6 317 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GAREM1Q9H706 876 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPTLC3Q9NUV7 552 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SAMD15Q9P1V8 674 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRFN1Q9P244 771 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VAV3Q9UKW4 847 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ST14Q9Y5Y6 855 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCN1AP35498 2009 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.83□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYT5O00445 386 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AQP7O14520 342 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 N4BP3O15049 544 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FLRT2O43155 660 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THAP12O43422 761 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FMO6PO60774 539 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RTN2O75298 545 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLU7O95391 586 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LARGE1O95461 756 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STAMBPO95630 424 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRTAMO95727 393 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PAHP00439 452 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THBDP07204 575 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD3EP07766 207 aa5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms