RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430445.1

RAB17-208, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB17, Length 421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM159	Q96B96	161 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	WDR92	Q96MX6	357 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	CMKLR1	Q99788	373 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	OR1A2	Q9Y585	309 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	FLNC	Q14315	2725 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	C9orf172	C9J069	976 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	INSIG1	O15503	277 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	PCCB	P05166	539 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	MME	P08473	750 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	PNLIP	P16233	465 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	SUOX	P51687	545 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	CYP4F2	P78329	520 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	AGER	Q15109	404 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	NAA35	Q5VZE5	725 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	SPRED1	Q7Z699	444 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	USP7	Q93009	1102 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	EXOC2	Q96KP1	924 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445		A0A1W2PQC6	194 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	PIGN	O95427	931 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	SDC4	P31431	198 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	LIG3	P49916	1009 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	MTM1	Q13496	603 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	UGP2	Q16851	508 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	KLC2	Q9H0B6	622 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	NDST4	Q9H3R1	872 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	LHX3	Q9UBR4	397 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	SDK2	Q58EX2	2172 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	RELN	P78509	3460 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	TSPAN11	A1L157	253 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	CD82	P27701	267 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	HDAC4	P56524	1084 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	TLE1	Q04724	770 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.86	□□□□□ -0.19	2e-16	■□□□□ 9.3
RAB17-208	ENST00000430445	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	PHF19	Q5T6S3	580 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	ERAP2	Q6P179	960 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RAB17-208	ENST00000430445	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19

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