RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, human

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1A-204	ENST00000424089	CHD6	Q8TD26	2715 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	PRAMEF11	O60813	436 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	UNC5C	O95185	931 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	TBX18	O95935	607 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	GLUD1	P00367	558 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	TPH1	P17752	444 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	NMBR	P28336	390 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	CRABP2	P29373	138 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	OR1E1	P30953	314 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	OCRL	Q01968	901 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	BST1	Q10588	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	PLD1	Q13393	1074 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	CHI3L2	Q15782	390 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	TAF12	Q16514	161 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ALF	Q53S48	1182 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	CES3	Q6UWW8	571 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	GPR152	Q8TDT2	470 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	GIPC2	Q8TF65	315 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	INPP5D	Q92835	1189 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	PTPRN2	Q92932	1015 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	TMEM237	Q96Q45	408 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	GPR22	Q99680	433 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	NPHS2	Q9NP85	383 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	TREX1	Q9NSU2	369 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	UBP1	Q9NZI7	540 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	TLK1	Q9UKI8	766 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	CHKB	Q9Y259	395 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	PSAT1	Q9Y617	370 aa		10.12	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ILVBL	A1L0T0	632 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089		J3KR12	359 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	LAMTOR5	O43504	91 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC22	O60826	627 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	PMPCB	O75439	489 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SOAT2	O75908	522 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	CNTN5	O94779	1100 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	PROC	P04070	461 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SERPINE1	P05121	402 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	CPA3	P15088	417 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	HLA-DPA1	P20036	260 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ELF1	P32519	619 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	CSRP3	P50461	194 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	NCALD	P61601	193 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ARHGAP8	P85298	464 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC20A2	Q08357	652 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ITK	Q08881	620 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ASPH	Q12797	758 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	OLIG2	Q13516	323 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	RIPK1	Q13546	671 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	SLC12A1	Q13621	1099 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	KRT72	Q14CN4	511 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	TBCC	Q15814	346 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	MBLAC2	Q68D91	279 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ASRGL1	Q7L266	308 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	CLEC14A	Q86T13	490 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ITIH5	Q86UX2	942 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	LGI2	Q8N0V4	545 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	PJA1	Q8NG27	643 aa		10.11	□□□□□ -0.79
POLR1A-204	ENST00000424089	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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