RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC103Q8IW40 242 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ADHFE1Q8IWW8 467 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CD48P09326 243 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 TCF3P15923 654 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 FGFR3P22607 806 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 NEDD8Q15843 81 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 MTERF3Q96E29 417 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CYLDQ9NQC7 956 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 PEAK1Q9H792 1746 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CDH13P55290 713 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 NRF1Q16656 503 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CAMK1DQ8IU85 385 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SIX2Q9NPC8 291 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 PNPOQ9NVS9 261 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SPATA31D3P0C874 917 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CRATP43155 626 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 PRKG2Q13237 762 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 NACC2Q96BF6 587 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ACBD6Q9BR61 282 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 GLUD1P00367 558 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 NOS3P29474 1203 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 USP4Q13107 963 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 BNIPLQ7Z465 357 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 DPP10Q8N608 796 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CDH19Q9H159 772 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 LRMDAQ9H2I8 198 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 FZD8Q9H461 694 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 E9PAM4 449 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 PTGES3LE9PB15 166 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 RHOQP17081 205 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 NTSP30990 170 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 PLLPQ9Y342 182 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ENTPD5O75356 428 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SKP1P63208 163 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 RORBQ92753 470 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 PCED1BQ96HM7 432 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 NDOR1Q9UHB4 597 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC28A1O00337 649 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM38O00635 465 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC185Q8N715 623 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 RCN3Q96D15 328 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 MYO19Q96H55 970 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 C22orf31O95567 290 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ABRQ12979 859 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP44Q9C0F1 390 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 PSME2Q9UL46 239 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 LTN1O94822 1766 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SLIT2O94813 1529 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SPIDRQ14159 915 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 VN1R5Q7Z5H4 357 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 DAW1Q8N136 415 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 PLK2Q9NYY3 685 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CFAP97Q9P2B7 532 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM155BO75949 473 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CTSEP14091 401 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CRHR1P34998 444 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 HADHBP55084 474 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 XKR6Q5GH73 641 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT73Q86Y46 540 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 TRMOQ9BU70 441 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf50Q9BV19 199 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SDCBP2Q9H190 292 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRAC1Q9NRG0 131 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 MSRAQ9UJ68 235 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 C5orf60A6NFR6 353 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 BCL10O95999 233 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms