RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa28.39■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 DKK3Q9UBP4 350 aa28.39■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 SHOC2Q9UQ13 582 aa28.39■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 KMT2EQ8IZD2 1858 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 A0A1W2PP55 124 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 FAM86C2PA6NEL3 165 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 PIRTP0C851 137 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 TIMP2P16035 220 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ITIH2P19823 946 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 C5AR1P21730 350 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 SEMG2Q02383 582 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 BBOF1Q8ND07 529 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 IFT81Q8WYA0 676 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 PWWP2AQ96N64 755 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ADGRE3Q9BY15 652 aa28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 UPK3BL1B0FP48 263 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 UPK3BL2E5RIL1 263 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 EPOP01588 193 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ALPIP09923 528 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 HLA-DPA1P20036 260 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 P2RY2P41231 377 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ABL2P42684 1182 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 CXCL12P48061 93 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 PXNP49023 591 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 DRG2P55039 364 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 PLTPP55058 493 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 CDK16Q00536 496 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 LINC00523Q86TU6 105 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 HDDC3Q8N4P3 179 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 GANCQ8TET4 914 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 NEUROG2Q9H2A3 272 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 CASS4Q9NQ75 786 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 GDF3Q9NR23 364 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 FAM114A2Q9NRY5 505 aa28.37■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 FGF1P05230 155 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 TPH1P17752 444 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 GRIA4P48058 902 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 CARSP49589 748 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 CCR3P51677 355 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 NEK3P51956 506 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 DNAAF3Q8N9W5 541 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 MCUQ8NE86 351 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 FBXO25Q8TCJ0 367 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ART4Q93070 314 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 SERPINB12Q96P63 405 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 TPSD1Q9BZJ3 242 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 FBXL12Q9NXK8 326 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 PHTF1Q9UMS5 762 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ITM2BQ9Y287 266 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 SCN8AQ9UQD0 1980 aa28.36■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 A0A0U1RQS6 177 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD66B4E2M5 251 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 AVILO75366 819 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ALDH1A2O94788 518 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 APBB3O95704 486 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ACADMP11310 421 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ADRB3P13945 408 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 XPAP23025 273 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 RPL26P61254 145 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 UGP2Q16851 508 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM31Q5JXX7 168 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 FBXL19Q6PCT2 694 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 IFT20Q8IY31 132 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 FBXL6Q8N531 539 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 SPOCK2Q92563 424 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 OMDQ99983 421 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 HDAC8Q9BY41 377 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 PCDH12Q9NPG4 1184 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 DOCK9Q9BZ29 2069 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 A0A0J9YYE9 177 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 A0A1W2PQ67 120 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 SPINT1O43278 529 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 TRBC1P01850 177 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 TUBB4BP68371 445 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ZBTB16Q05516 673 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 CDH17Q12864 832 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 AGBL4Q5VU57 503 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 TTC7BQ86TV6 843 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 HCAR2Q8TDS4 363 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 GGT7Q9UJ14 662 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 SPO11Q9Y5K1 396 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 A8MX80 341 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 K7ESF4 209 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 NDC80O14777 642 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 C7P10643 843 aa28.34■■■□□ 2.13
GIPC1-202ENST00000393028 SARNPP82979 210 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms