RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 TXLNGYQ9BZA5 131 aa29.79■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP29.79■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 PPFIA2O75334 1257 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 DNTTP04053 509 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 C5AR1P21730 350 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 LMAN1P49257 510 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 CDK18Q07002 472 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 SPARCL1Q14515 664 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 ARMC12Q5T9G4 340 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 ZSWIM9Q86XI8 627 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 PGBD3Q8N328 593 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 MDGA1Q8NFP4 955 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 IFT43Q96FT9 208 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 FZD6O60353 706 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 PGLSO95336 258 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 AP2A1O95782 977 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 C7P10643 843 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 ITGB7P26010 798 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 OLIG2Q13516 323 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 SLMAPQ14BN4 828 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 PPIL6Q8IXY8 311 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 AADATQ8N5Z0 425 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 TRIB3Q96RU7 358 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf16Q9NQ32 467 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 DYRK4Q9NR20 520 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 DKK3Q9UBP4 350 aa29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 C16orf96A6NNT2 1141 aa29.77■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 PLK4O00444 970 aa29.77■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 PSMD3O43242 534 aa29.77■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 APBB3O95704 486 aa29.77■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 PRLP01236 227 aa29.77■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB16Q05516 673 aa29.77■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 BRAT1Q6PJG6 821 aa29.77■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 CAMKK1Q8N5S9 505 aa29.77■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 CPT1BQ92523 772 aa29.77■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 FEM1CQ96JP0 617 aa29.77■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 FICDQ9BVA6 458 aa29.77■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
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ECHS1-201ENST00000368547 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa29.76■■■□□ 2.36
ECHS1-201ENST00000368547 TSPAN11A1L157 253 aa29.76■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 USP12O75317 370 aa29.76■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 SASH3O75995 380 aa29.76■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 AGTP01019 485 aa29.76■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 ACADMP11310 421 aa29.76■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 ADRA1AP35348 466 aa29.76■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 HCAR2Q8TDS4 363 aa29.76■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 APOL2Q9BQE5 337 aa29.76■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 PHACTR1Q9C0D0 580 aa29.76■■■□□ 2.35
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ECHS1-201ENST00000368547 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa29.75■■■□□ 2.35
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ECHS1-201ENST00000368547 KCNJ11Q14654 390 aa29.75■■■□□ 2.35
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ECHS1-201ENST00000368547 LPCAT1Q8NF37 534 aa29.75■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 TBL1YQ9BQ87 522 aa29.75■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRE3Q9BY15 652 aa29.75■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
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ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PQ67 120 aa29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 EPOP01588 193 aa29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEA6P43360 314 aa29.74■■■□□ 2.35
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ECHS1-201ENST00000368547 NAT8LQ8N9F0 302 aa29.74■■■□□ 2.35
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ECHS1-201ENST00000368547 PIH1D2Q8WWB5 315 aa29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 SPOCK2Q92563 424 aa29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 OMDQ99983 421 aa29.74■■■□□ 2.35
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ECHS1-201ENST00000368547 NDST3O95803 873 aa29.74■■■□□ 2.35
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ECHS1-201ENST00000368547 P2RY2P41231 377 aa29.74■■■□□ 2.35
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ECHS1-201ENST00000368547 EPHB1P54762 984 aa29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 TPSAB1Q15661 275 aa29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 UGP2Q16851 508 aa29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC73Q5JTD7 316 aa29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 FBXL19Q6PCT2 694 aa29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 RANBP10Q6VN20 620 aa29.74■■■□□ 2.35
ECHS1-201ENST00000368547 TTC7BQ86TV6 843 aa29.74■■■□□ 2.35
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