RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCN4BQ8IWT1 228 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 VPS52Q8N1B4 723 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC39A11Q8N1S5 342 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF152Q8N8N0 203 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCAIQ8N9R8 606 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 GLIS1Q8NBF1 620 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4N2Q8NGD1 307 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2L2Q8NH16 312 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 PARD3BQ8TEW8 1205 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 DUSP19Q8WTR2 217 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNRF4Q8WWF5 429 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 GDF15Q99988 308 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM31Q9BZY9 425 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXorf56Q9H5V9 222 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACAD9Q9H845 621 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNPLA8Q9NP80 782 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 HELLSQ9NRZ9 838 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM30AQ9NV96 361 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC52A1Q9NWF4 448 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANAPC11Q9NYG5 84 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 NYAP2Q9P242 653 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYO1AQ9UBC5 1043 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF180Q9UJW8 692 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 RARRES3Q9UL19 164 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CA14Q9ULX7 337 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDC14AQ9UNH5 594 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CORO2BQ9UQ03 480 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 C2CD2Q9Y426 696 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM157AC9JC47 383 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYN3O14994 580 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 RASA4O43374 803 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZFAND5O76080 213 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 NTSR2O95665 410 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV4-39P01824 125 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TFRCP02786 760 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 HRGP04196 525 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANXA6P08133 673 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 MMP2P08253 660 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPL17P18621 184 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TYMPP19971 482 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 S1PR1P21453 382 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP2K2P36507 400 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPHB1P54762 984 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM193AP78312 1265 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC18A2Q05940 514 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDK18Q07002 472 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF543Q08ER8 600 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TUBB2AQ13885 445 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLEKHG6Q3KR16 790 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNT1Q5JUK3 1230 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 DOK6Q6PKX4 331 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC149Q6ZUS6 474 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRSK2Q8IWQ3 736 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1orf87Q8N0U7 546 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC33Q8N5R6 958 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2T6Q8NHC8 308 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 RASSF8Q8NHQ8 419 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRHL3Q8TE85 626 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNJ9Q92806 393 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERGIC1Q969X5 290 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDCA5Q96FF9 252 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCRN2Q96FV2 425 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGAP3Q96P47 875 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 YME1L1Q96TA2 773 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TUBB2BQ9BVA1 445 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOL5Q9BWW9 433 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYSLTR2Q9NS75 346 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 HOMER2Q9NSB8 354 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1orf112Q9NSG2 853 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD10Q9NXR5 420 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR83Q9NYM4 423 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRHL1Q9NZI5 618 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHPF2Q9P2E5 772 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 NLKQ9UBE8 527 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 PADI1Q9ULC6 663 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFU1Q9UMS0 254 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2W1Q9Y3N9 320 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNX13Q9Y5W8 968 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 DISP3Q9P2K9 1392 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0G2JLW4 131 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 POM121BA6NF01 834 aa0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms