RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 CREG2Q8IUH2 290 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 AP3S1Q92572 193 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ADAM2Q99965 735 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SASH3O75995 380 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 FSBPO95073 299 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 TTPAP49638 278 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SNX3O60493 162 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 CCNB1P14635 433 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 C5orf22Q49AR2 442 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ULK3Q6PHR2 472 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 PJA1Q8NG27 643 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 GIT1Q9Y2X7 761 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 IRAK3Q9Y616 596 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 UNC5CO95185 931 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SERPINA1P01009 418 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ADORA2AP29274 412 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 GPR180Q86V85 440 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 TRIM17Q9Y577 477 aa16.14■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 PGRMC2O15173 223 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ENTPD5O75356 428 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 CXCL9Q07325 125 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SCRN3Q0VDG4 424 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SPDYCQ5MJ68 293 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ISM1B1AKI9 464 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ADM5C9JUS6 153 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 AREL1O15033 823 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 PIRTP0C851 137 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 AKR1A1P14550 325 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 RAB10P61026 200 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 MAMLD1Q13495 774 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SMCO1Q147U7 214 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 DENND1CQ8IV53 801 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 RCN3Q96D15 328 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 TNFSF13BQ9Y275 285 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SLC28A2O43868 658 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SCNN1GP51170 649 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 BST1Q10588 318 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 PTCHD4Q6ZW05 846 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SLC16A10Q8TF71 515 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 LRRN4Q8WUT4 740 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 GSAPA4D1B5 854 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 TBL1XO60907 577 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ATP6AP2O75787 350 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 CAPGP40121 348 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 BNIP2Q12982 314 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 IL18R1Q13478 541 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 PIH1D2Q8WWB5 315 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SLC47A1Q96FL8 570 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 URADA6NGE7 173 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 DLG4P78352 724 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 RGS1Q08116 209 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 CD101Q93033 1021 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.13■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 ZNF879B4DU55 563 aa16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 PRODHO43272 600 aa16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 LIASO43766 372 aa16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 EPHA3P29320 983 aa16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 OR4A15Q8NGL6 344 aa16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 GGA2Q9UJY4 613 aa16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 RFXANKO14593 260 aa16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 SERPINB7O75635 380 aa16.12■□□□□ 0.17
RXRA-201ENST00000356384 OTCP00480 354 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms