RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333496.14

CLN3-201, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-201ENST00000333496 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
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CLN3-201ENST00000333496 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-201ENST00000333496 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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CLN3-201ENST00000333496 AMACRQ9UHK6 382 aa15.91■□□□□ 0.14
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CLN3-201ENST00000333496 PTPRBP23467 1997 aa15.91■□□□□ 0.14
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