RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 FZD6O60353 706 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 FSBPO95073 299 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 GDF10P55107 478 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PTPRRQ15256 657 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PID1Q7Z2X4 250 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 TADA1Q96BN2 335 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SMIM14Q96QK8 99 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 RAB23Q9ULC3 237 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.31■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 DOCK9Q9BZ29 2069 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 LRRC72A6NJI9 287 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 F5H423 210 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SOCS5O75159 536 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 EPN2O95208 641 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PRLP01236 227 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 NFKB1P19838 968 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 DCLK2Q8N568 766 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 AP1G1O43747 822 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PGLSO95336 258 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 CES1P23141 567 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 CREB5Q02930 508 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SNX1Q13596 522 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC6Q16204 474 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SPOCK2Q92563 424 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 FOXJ1Q92949 421 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 RAB7BQ96AH8 199 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 LOXL4Q96JB6 756 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 VAT1Q99536 393 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PREBQ9HCU5 417 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 CHKBQ9Y259 395 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SERPINF2P08697 491 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 VSNL1P62760 191 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PRELID2Q8N945 189 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 UBP1Q9NZI7 540 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PILRBQ9UKJ0 227 aa20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1W2PQU0 124 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 LATO43561 262 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PCDH8O95206 1070 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 RETP07949 1114 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 CCR5P51681 352 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 FGL2Q14314 439 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 PIGKQ92643 395 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 KLK6Q92876 244 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 FCRL5Q96RD9 977 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 MEI4A8MW99 385 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 WNT9AO14904 365 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 SASH3O75995 380 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 CCNG2Q16589 344 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF284Q2VY69 593 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB11B-201ENST00000328024 CFAP58Q5T655 872 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms